MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 42572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008309	ATG	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008309	AAT	2	6	57	62	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008309	A	7	7	155	161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008309	CTT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008309	ATT	2	6	200	205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008309	T	6	6	204	209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008309	AAT	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008309	A	6	6	266	271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008309	TTA	3	9	289	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008309	CAA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008309	T	8	8	304	311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008309	GAA	2	6	335	340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008309	TGTGA	2	10	378	387	20 %	40 %	40 %	0 %	113460150
14	NC_008309	AAT	2	6	519	524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
15	NC_008309	ATTT	2	8	556	563	25 %	75 %	0 %	0 %	113460150
16	NC_008309	TAA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
17	NC_008309	T	6	6	624	629	0 %	100 %	0 %	0 %	113460150
18	NC_008309	TAG	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460150
19	NC_008309	GAA	2	6	639	644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460150
20	NC_008309	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460150
21	NC_008309	GTTA	2	8	686	693	25 %	50 %	25 %	0 %	113460150
22	NC_008309	TAA	2	6	794	799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
23	NC_008309	AGAT	2	8	830	837	50 %	25 %	25 %	0 %	113460150
24	NC_008309	TCT	2	6	888	893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460150
25	NC_008309	AT	3	6	916	921	50 %	50 %	0 %	0 %	113460150
26	NC_008309	ACA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460150
27	NC_008309	TGA	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460150
28	NC_008309	AAT	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
29	NC_008309	TAT	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460150
30	NC_008309	T	8	8	1317	1324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008309	GGT	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008309	CTC	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008309	CAG	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008309	GAG	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008309	GTTA	2	8	1480	1487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008309	TGT	2	6	1488	1493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008309	ATT	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008309	AATTTA	2	12	1577	1588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008309	CAA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008309	A	6	6	1765	1770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008309	ATG	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008309	T	6	6	1791	1796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008309	A	7	7	1808	1814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008309	AAT	2	6	1825	1830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008309	TAA	3	9	1834	1842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008309	CTTTT	2	10	1853	1862	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008309	TA	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008309	ATTA	2	8	1897	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008309	AT	3	6	2013	2018	50 %	50 %	0 %	0 %	113460151
50	NC_008309	TAT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460151
51	NC_008309	TCG	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
52	NC_008309	CAA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460151
53	NC_008309	TGA	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460151
54	NC_008309	T	8	8	2298	2305	0 %	100 %	0 %	0 %	113460151
55	NC_008309	TAA	2	6	2408	2413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460151
56	NC_008309	G	6	6	2499	2504	0 %	0 %	100 %	0 %	113460151
57	NC_008309	ACAG	2	8	2533	2540	50 %	0 %	25 %	25 %	113460151
58	NC_008309	TGC	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
59	NC_008309	CTG	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
60	NC_008309	CTT	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460151
61	NC_008309	AAAT	2	8	2651	2658	75 %	25 %	0 %	0 %	113460151
62	NC_008309	TGG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460151
63	NC_008309	GTA	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460151
64	NC_008309	GATT	2	8	2798	2805	25 %	50 %	25 %	0 %	113460151
65	NC_008309	ATT	2	6	2836	2841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460151
66	NC_008309	AAAT	2	8	2865	2872	75 %	25 %	0 %	0 %	113460151
67	NC_008309	G	6	6	3024	3029	0 %	0 %	100 %	0 %	113460151
68	NC_008309	CTG	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
69	NC_008309	CAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460151
70	NC_008309	A	6	6	3154	3159	100 %	0 %	0 %	0 %	113460151
71	NC_008309	T	7	7	3248	3254	0 %	100 %	0 %	0 %	113460151
72	NC_008309	GAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460151
73	NC_008309	GAT	2	6	3349	3354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008309	ATC	2	6	3367	3372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008309	TACT	2	8	3395	3402	25 %	50 %	0 %	25 %	113460152
76	NC_008309	CTAG	2	8	3408	3415	25 %	25 %	25 %	25 %	113460152
77	NC_008309	GTT	2	6	3448	3453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460152
78	NC_008309	ATC	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460152
79	NC_008309	CAG	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460152
80	NC_008309	ATC	2	6	3593	3598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460152
81	NC_008309	CCA	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460152
82	NC_008309	T	6	6	3624	3629	0 %	100 %	0 %	0 %	113460152
83	NC_008309	TGC	2	6	3635	3640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460152
84	NC_008309	CCA	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460152
85	NC_008309	AAT	2	6	3767	3772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460152
86	NC_008309	ACA	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460152
87	NC_008309	TAT	2	6	3949	3954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008309	TAA	2	6	3971	3976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008309	A	6	6	3982	3987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008309	ACT	2	6	4019	4024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460153
91	NC_008309	CTT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460153
92	NC_008309	AGA	2	6	4073	4078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460153
93	NC_008309	ATT	2	6	4095	4100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460153
94	NC_008309	T	7	7	4121	4127	0 %	100 %	0 %	0 %	113460153
95	NC_008309	TGA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460153
96	NC_008309	GTA	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460153
97	NC_008309	AT	3	6	4283	4288	50 %	50 %	0 %	0 %	113460153
98	NC_008309	GAA	2	6	4422	4427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460153
99	NC_008309	TTAA	2	8	4482	4489	50 %	50 %	0 %	0 %	113460153
100	NC_008309	GAA	2	6	4500	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460153
101	NC_008309	TA	3	6	4518	4523	50 %	50 %	0 %	0 %	113460153
102	NC_008309	CGG	2	6	4532	4537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460153
103	NC_008309	AAT	2	6	4578	4583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460153
104	NC_008309	T	6	6	4685	4690	0 %	100 %	0 %	0 %	113460153
105	NC_008309	CAA	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460153
106	NC_008309	AACC	2	8	4707	4714	50 %	0 %	0 %	50 %	113460153
107	NC_008309	CAA	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460153
108	NC_008309	GTA	2	6	4983	4988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460153
109	NC_008309	CAT	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460153
110	NC_008309	CTT	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460153
111	NC_008309	A	7	7	5304	5310	100 %	0 %	0 %	0 %	113460153
112	NC_008309	CGAT	2	8	5320	5327	25 %	25 %	25 %	25 %	113460153
113	NC_008309	TATC	2	8	5332	5339	25 %	50 %	0 %	25 %	113460153
114	NC_008309	ACAAG	2	10	5461	5470	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008309	AGCA	2	8	5503	5510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008309	T	6	6	5561	5566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008309	AAC	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008309	TGCT	2	8	5637	5644	0 %	50 %	25 %	25 %	113460154
119	NC_008309	TCC	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460154
120	NC_008309	AGC	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
121	NC_008309	CTT	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460154
122	NC_008309	T	6	6	5963	5968	0 %	100 %	0 %	0 %	113460154
123	NC_008309	T	6	6	6023	6028	0 %	100 %	0 %	0 %	113460154
124	NC_008309	CAAG	2	8	6052	6059	50 %	0 %	25 %	25 %	113460154
125	NC_008309	CAT	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
126	NC_008309	TCA	2	6	6097	6102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
127	NC_008309	AT	3	6	6271	6276	50 %	50 %	0 %	0 %	113460154
128	NC_008309	C	6	6	6322	6327	0 %	0 %	0 %	100 %	113460154
129	NC_008309	TAA	2	6	6341	6346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
130	NC_008309	CAA	2	6	6348	6353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460154
131	NC_008309	ATT	2	6	6436	6441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460154
132	NC_008309	TAA	2	6	6570	6575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
133	NC_008309	TCA	2	6	6589	6594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
134	NC_008309	GTT	2	6	6599	6604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460154
135	NC_008309	TTC	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460154
136	NC_008309	AAT	2	6	6669	6674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
137	NC_008309	ATA	2	6	6756	6761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
138	NC_008309	TCA	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
139	NC_008309	CTC	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460154
140	NC_008309	TAAG	2	8	6923	6930	50 %	25 %	25 %	0 %	113460154
141	NC_008309	G	6	6	6930	6935	0 %	0 %	100 %	0 %	113460154
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